几天后，嘉明召集李清扬商议有关南巡事宜；经过几位心腹大臣建议他决定在此之前先定下几件大事：一是进行内阁改组，李清扬仍旧担任内阁总理大臣；上官云任副总理兼内政大臣；风亦凡仍是国防大臣，但嘉明在国防部下设陆军部.空军部.海军部等三个副部级单位；而将总参谋部及联勤总部独立出去直属于他的最高国防委员会！欧阳昊升任最高国防委员会秘书长(与国防部长平级)仍兼任总参谋长；同时调昆明军区司令员黄小明升任陆军部大臣，杭州军区司令员杨明华升任空军部大臣；而原海军司令员胡平则转任海军部大臣！

为更好的加强对军队的控制与管理，天佑皇帝还做出了如下安排：即国防部负责军队的日常管理及对外进行军事交流派驻武官等；此外国防部还有奉旨调兵遣将以及向最高国防委员会举荐将领升迁调任的建议权！

而总参谋部则负责军队战时指挥权，同时还有对军队平常训练及将领奖惩的建议权！如此一来不仅让各部门间更好地沟通协调做到分工明确权责清晰，也少了以往争功诿过的扯皮现象；更重要的是将军队的带与管分离，至此以往军中将领拥兵自重的现象将彻底不复再现！

楚天雄除担任国安部大臣外还兼领新设立的国家情报总监一职，总领中央情报局（主要负责对外收集情报工作，局长为林峰）和国家安全局（主要负责对内反特侦察工作，局长为蒋勇）；此外还统率着近30万的精锐内卫部队,真可谓是位高权重了！

由于许世桢已出任最高法院院长兼首席大法官，而原交通大臣陆少东因受贿罪业已伏法！故而他们的遗缺皆由副部长屈扬和蒙和升任！其它各部大臣基本上留任，但嘉明仍充实了不少年轻的留学生担任见习；有才能特别出众的甚至加封为司局长