被称为“日本警察的救世主”、“平成年代的福尔摩斯”的高中生侦探工藤新一在一次与青梅竹马毛利兰去游乐园游玩时发现两个行动诡异的黑衣男子，于是新一独自跟踪了他们，却不料被其中一名黑衣男子偷袭并灌下一种名为“APTX4869”的神秘毒药，虽然因体质特殊免遭死亡，但是因为药物副作用，新一的身体回到了孩童状态。如果黑衣组织知道新一还活着的话必定会使周围的人受到牵连，所以他化名为“江户川柯南”，寄住在父亲为侦探的毛利兰家中企图寻找黑衣组织的线索。他用阿笠博士发明的手表型麻醉枪让毛利兰的父亲同时也是个冒失的糊涂侦探毛利小五郎睡着，接着用蝴蝶结变声器模仿他的声音来进行推理，解决了许多案件并一直在追查黑衣组织，期待把黑衣组织绳之以法并变回原来的样子，同时也结交了许多伙伴。
毛利梓
性别：女
年龄：十七岁
擅长：你说呢？当然是全部都擅长啊！！
外貌：跟小兰长得一模一样，唯一不同的是她有*项链和花形水晶手链以及丢失的蝴蝶手链。
主要人物
江户川柯南（江戸川コナン）
本故事的主人公。真实身份为高中生侦探工藤新一，由于被黑衣组织的成员灌下毒药“APTX4869”而导致身体变小，之后化名为“江户川柯南”，为了调查黑衣组织而寄住在毛利侦探事务所。就读于帝丹小学一年级B班。
工藤新一（くどうしんいち）
帝丹高中二年级B班学生，高中生侦探，被称为“平成年代的福尔摩斯”、“日本警察的救世主”，很多案件在他的活跃之下得以侦破。后来被黑衣组织灌下毒药，身体变小，化名为江户川柯南。
毛利兰（もうりらん）
本故事的女主角。帝丹高中二年级B班学生，毛利小五郎的女儿，帝丹高中空手道社的主将，新一的青梅竹马。像弟弟一样对待柯南。
毛利小五郎（モーリこごろう）
小兰、小梓的父亲。曾经是警察，后来改行做了私家侦探。多数时候是头脑迷糊的糊涂侦探，需要借助柯南的力量才能破案，但是一旦遇到牵涉到和自己有关的人的案子，就会表现出惊人的推理能力。擅长柔道。
阿笠博士家
阿笠博士（あがさひろし）
新一的邻居，发明家。和工藤优作是好友。曾经有过不少发明，不过大多数是失败作品。新一变小成为柯南后，为了帮助柯南而发明了很多有用的道具。
灰原哀（はいばらあい）
帝丹小学一年级B班学生。真实身份是黑衣组织成员宫野志保（组织代号“雪莉”），后来因姐姐明美被杀，拒绝与组织合作而被囚禁，为此服下“APTX4869”而使身体变小，之后住在阿笠博士家。
少年侦探团
江户川柯南（江戸川コナン）
本故事的主人公。真实身份为高中生侦探工藤新一，由于被黑衣组织的成员灌下毒药“APTX4869”而导致身体变小，之后化名为“江户川柯南”，为了调查黑衣组织而寄住在毛利侦探事务所。就读于帝丹小学一年级B班。
吉田步美（よしだあゆみ）
帝丹小学一年级B班学生。性格天真善良的女孩，喜欢柯南。
圆谷光彦（つぶらやみつひこ）
帝丹小学一年级B班学生。十分热衷于学习科学，思维模式较理性化，喜欢步美和小哀。
小岛元太（こじまげんた）
帝丹小学一年级B班学生，少年侦探团的团长（自称）。非常贪吃，最喜欢的食物是鳗鱼饭。性格比较莽撞，不过很有正义感。喜欢步美。
灰原哀（はいばらあい）
帝丹小学一年级B班学生。真实身份是黑衣组织成员宫野志保（组织代号“雪莉”），后来因姐姐明美被杀，拒绝与组织合作而被囚禁，为此服下“APTX4869”而使身体变小，之后住在阿笠博士家。
小林澄子（こばやしすみこ）
帝丹小学一年级B班的班主任老师，少年侦探团的顾问（自称）。喜欢阅读江户川乱步的小说。小时候和白鸟警官有过一面之缘，目前和白鸟警官交往中。
新一的家人
工藤优作（くどうゆうさく）
新一的父亲，世界首屈一指的推理小说家，代表作品是《暗夜男爵》系列，现定居于美国洛杉矶。目暮警官的好友。推理能力在新一之上。自阿笠博士处得知新一变小的事情。
工藤有希子（くどうゆきこ）
旧姓藤峰。新一的母亲，曾经是著名的女演员，但后来退出演艺界并和优作结婚。性格活泼，擅长易容和变装。曾经与美国女星莎朗·温亚德（贝尔摩德）是好友。
小兰、小梓的家人
毛利小五郎（モーリこごろう）
小兰、小梓的父亲。曾经是警察，后来改行做了私家侦探。多数时候是头脑迷糊的糊涂侦探，需要借助柯南的力量才能破案，但是一旦遇到牵涉到和自己有关的人的案子，就会表现出惊人的推理能力。擅长柔道。
妃英理（きさきえり）
小兰、小梓的母亲，著名律师，号称“法庭的女王”，有着从未败诉的纪录。小五郎的青梅竹马。目前和小五郎分居中。
大阪的人物
服部平次（はっとりへいじ）
配音演员：堀川亮
大阪的高中生侦探，与工藤新一齐名，二人合称“关东的工藤，关西的服部”。特征是黑色皮肤，说话带有关西腔。在某起案件中得知柯南的真实身份，并多次协助柯南。擅长剑道。
远山和叶（とおやまかずは）
配音演员：宫村优子
平次的青梅竹马，擅长合气道。说话带有关西腔，自称是“平次的姐姐”。喜欢平次，不过两人在一起时经常闹别扭。性格开朗活泼，和小兰、小梓是好友。
服部平藏（はっとりへいぞう）
配音演员：小山武宏
大阪府警本部长，平次的父亲。剑道和推理能力很强。平时总是不苟言笑，也对平次很严格，是典型的严父形象。
服部静华（はとりしずか）
配音演员：胜生真沙子
旧姓池波，平次的母亲，虽然42岁，但是其相貌仍显得非常年轻。擅长剑道、烹饪。
远山银司郎（とおやまぎんしろう）
配音演员：佐古正人→小川真司
大阪府警刑事部长，和叶的父亲，服部平藏的好友兼得力下属。
大泷悟郎（おおたきごろう）
配音演员：若本规夫，小野坂昌也（少年期）
大阪府警搜查一课强行犯搜查系的警部。和平次的关系很好。
警视厅
目暮十三（めぐれじゅうぞう）
配音演员：茶风林
警视厅刑事部搜查一课强行犯搜查三系的警部，小五郎当刑警时的上司。身材肥胖，并且总是戴着帽子。曾经多次得到新一的帮助而破案，现在则是仰仗小五郎。
高木涉（たかぎわたる）
配音演员：高木涉
警视厅刑事部搜查一课强行犯搜查三系的巡查部长，目暮警官的部下。性格温和而有正义感，喜欢佐藤警官，目前与佐藤警官交往中。名字来源于同名配音演员。
佐藤美和子（さとうみわこ）
配音演员：汤屋敦子
警视厅刑事部搜查一课强行犯搜查三系的警部补，目暮警官的部下。是搜查一课之花，曾经受到包括高木、白鸟等多数男性警官的爱慕。目前与高木警官交往中。
白鸟任三郎（しらとりにんざぶろう）
配音演员：盐泽兼人→井上和彦，本田贵子（幼年期）
警视厅刑事部搜查一课强行犯搜查三系的警部。小时候与小林老师有过一面之缘，但后来却误以为那是佐藤警官，并一直为此追求佐藤警官，后来才发现小林老师才是自己的初恋。目前与小林老师交往中。
千叶警官（ちばかずのぶ）
配音演员：千叶一伸，爱河里花子（幼年期）
警视厅刑事部搜查一课强行犯搜查三系警官，全名为千叶和伸（漫画942话中终于出现全名）。目暮警官的部下，高木的同事兼后辈，初恋情人是三池苗子。
松本清长（まつもときよなが）
配音演员：加藤精三
警视厅刑事部搜查一课的管理官（已卸任），左眼上有20年前“口哨男连续杀人案”中被凶手砍下的大伤疤。
黑田兵卫
原长野县警署搜查一课课长，后调任警视厅刑事部搜查一课管理官。右眼受伤的独眼大汉，被柯南当作朗姆的嫌疑人。
弓长警部（ゆみなが）
配音演员：德弘夏生
警视厅搜查一课纵火犯搜查一系警部，专管纵火案，全名不详。小五郎当刑警时的上司，被小五郎戏称为“火灾老爹”。
茶木神太郎（ちゃきしんたろう）
配音演员：田中信夫
警视厅刑事部搜查二课智能犯搜查系的警视，中森银三的上司。
中森银三（なかもりぎんぞう）
配音演员：石冢运升
警视厅刑事部搜查二课智能犯搜查系的警部，中森青子的父亲。专门负责怪盗基德的案件。十分执着于捉拿怪盗基德，但几乎每次都以失败告终。
百濑警部（もものせ）
配音演员：盐屋浩三
警视厅刑事部搜查三课的警部，全名不详。专管盗窃案。
宫本由美（みゃもとゆみ）
配音演员：杉本优
警视厅交通部交通课的警部补。佐藤的好友，喜欢撮合高木和佐藤。前男友是羽田秀吉。
三池苗子（みいけなえこ）
配音演员：田中理惠
原隶属杯户警署，后调任至警视厅交通课，警衔为巡查部长。是千叶的青梅竹马与初恋情人。
森村警视
配音演员：小西克幸
生前系警视厅刑事部搜查一课强行犯系警部补，全名不详。松本警视的好友，目暮警部十分尊敬的前辈。20年前在“口哨男连续杀人案”中殉职，后被追授为警视。（注：日本警察在殉职后警衔上升两级）
佐藤正义（さとうまさよし）
配音演员：大川透
生前系警视厅刑事部搜查一课警部，佐藤警官的父亲。在18年前的“愁思郎”案中殉职，后被追授为警视正。
萩原研二（はぎわらけんじ）
配音演员：三木真一郎
生前系警视厅警备部机动队爆炸物处理班成员，松田阵平的好友。7年前在处理炸弹时殉职。
松田阵平（まつだじんぺい）
配音演员：神奈延年
原隶属于警视厅警备部机动队爆炸物处理班，后来调职到搜查一课。对好友萩原研二的殉职一直耿耿于怀。在3年前的摩天轮爆炸事件中殉职，临死前以短信表达了对佐藤警官的好感。
伊达航（だてわたる）
配音演员：藤原启治
高木警官的前辈，与高木涉一起并称为“WataruBrothers”。1年前死于车祸。似乎与安室透有关联。
白马警视总监
配音演员：长嶝高士→福田信昭
警视厅警视总监，白马探的父亲，全名不详。仅在《魔术快斗》中登场，在《名侦探柯南》中只被提到。
诸星登志夫
配音演员：堀部隆一
剧场版原创人物，警视厅副总监，诸星秀树的祖父。登场于《贝克街的亡灵》。
小田切敏郎（おだぎりとしろう）
配音演员：中田浩二
剧场版原创人物，警视厅刑事部部长，警衔为警视长，小五郎当警察时的上司。登场于《瞳孔中的暗杀者》《天空的遇难船》及《沉默的15分钟》。
鲛崎岛治（さめざきとうじ）
配音演员：柴田秀胜
62岁。原警视厅搜查一课警视，小五郎当刑警时的上司。现已退休。
地方警察
横沟参悟（よこみぞさんご）
配音演员：大冢明夫
静冈县警的警部。原隶属埼玉县警。特征是形似珊瑚的发型（步美语）。十分崇拜小五郎。
横沟重悟（よこみぞじゅうご）
配音演员：大冢明夫
神奈川县警的警部，参悟的弟弟。和参悟长相十分相似，但是发型更接近光头。与哥哥相反，对于小五郎一类的侦探十分反感。
山村操（山村ミサオ）
配音演员：古川登志夫
群马县警的警部。由于崇拜有希子饰演的女警而成为警察，办案时经常会犯迷糊。胆子很小，常在命案现场劝人驱邪气，害怕诅咒等。是唯一被柯南麻醉过的警察。
大和敢助（やまとかんすけ）
配音演员：高田裕司
长野县警的警部。在追捕嫌犯时遭遇雪崩，导致左脚留下残疾、左眼留下伤疤。和上原由衣、诸伏高明是幼时的好友。
上原由衣（うえはらゆい）
配音演员：小清水亚美
长野县警的刑警，大和敢助的部下。和大和敢助、诸伏高明是幼时的好友。
诸伏高明（もろふしたかあき）
配音演员：速水奖
长野县警新野署的刑警，后来回归长野县警本部。对于三国志十分了解。被称为“孔明”。
绫小路文麿（あやのこうじふみまろ）
配音演员：置鲇龙太郎
剧场版原创人物，京都府警的警部，身上经常带着一只松鼠。登场于《迷宫的十字路》《漆黑的追踪者》及《绝海的侦探》。
铃木财团
铃木园子（すずきそのこ）
配音演员：松井菜樱子
小兰、小梓的同学、好友，铃木家次女。虽然出身富家，不过却毫无大小姐的架子，和周围朋友的关系都很不错，性格十分开朗豪放。曾经因找不到男朋友而苦恼，并此羡慕小兰和新一；目前和京极真交往中。
铃木史郎（すずきしろう）
配音演员：松冈文雄
铃木财团的会长，园子的父亲。
铃木朋子（すずきともこ）
配音演员：一柳みる
园子的母亲。一心希望与怪盗基德对决且战胜怪盗基德
铃木绫子（すずきあやこ）
配音演员：元井须美子→铃鹿千春
园子的姐姐，铃木家长女。和妹妹不同，很有名家之女的风范，待人很温和。和富泽财团的三子富泽雄三有婚约。
铃木次郎吉（すずきじろきち）
配音演员：永井一郎→富田耕生
铃木史郎的堂兄，铃木财团的顾问。爱好环游世界。十分痛恨怪盗基德，一直扬言要抓住基德，不过从来没成功过。爱犬的名字叫“鲁邦”。
西野真人（にしのまさと）
配音演员：宫本充
剧场版原创人物，登场于《世纪末的魔术师》。铃木史郎的秘书。曾旅居世界各国，擅长多国语言。
魔术快斗客串人物
怪盗基德（かいとうキッド）
全称“怪盗1412号”，以世界各地的珠宝为目标的大怪盗。柯南的对手之一。第一代为黑羽盗一，目前活动的为第二代——黑羽快斗。
《魔术快斗》的主人公，高中二年级学生，第二代怪盗基德，为了探查杀害父亲盗一的组织消息，一直在找寻神秘之石“潘多拉”。（注意：青山刚昌已明确表明此神秘组织与黑衣组织不是同一个组织）
黑羽盗一（くろばとういち）
配音演员：池田秀一
天才魔术师，第一代怪盗基德，快斗的父亲。黑羽快斗、工藤有希子、贝尔摩德的变装术都是师承于他。8年前在魔术表演中遭神秘组织暗杀身亡。
中森青子（なかもりあおこ）
配音演员：岩居由希子→高山南→藤村步→M·A·O
《魔术快斗》主角之一，快斗的青梅竹马，中森银三的女儿，不知道快斗就是怪盗基德。在《名侦探柯南》中仅在动画中正式登场，漫画中没有出现其姓名。
中森银三（なかもりぎんぞう）
配音演员：石冢运升
警视厅刑事部搜查二课智能犯搜查系的警部，中森青子的父亲。专门负责怪盗基德的案件。十分执着于捉拿怪盗基德，但几乎每次都以失败告终。
小泉红子（こいずみあかこ）
配音演员：林原惠美→泽城美雪→喜多村英梨
《魔术快斗》主角之一，拥有神秘气质的魔女，赤魔法的正统继承人。在《名侦探柯南》中仅在动画中登场，且未表现其使用魔法。
白马探（はくばさぐる）
配音演员：石田彰→宫野真守
《魔术快斗》主角之一，从英国留学归来的高中生侦探，白马警视总监的儿子，基德的主要对手。有一股少爷的骄傲气质。在《名侦探柯南》中侦探的聚会、比赛类型的故事中客串登场。
黑衣组织
那位先生（Boss）
黑衣组织的首领，已登场。被组织成员呼为“那位先生”或“Boss”，没有酒类代号，组织成员的代号都是他所起。除此之外一切信息不明。
朗姆（Rum）
黑衣组织的二号人物，Boss的心腹。性别不明，外貌有多种传闻。在事故中某只眼睛负伤，所以装的是义眼。
琴酒（Gin）
配音演员：堀之纪
黑衣组织重要成员。冷酷残忍，头脑冷静，似乎可以毫不犹豫地杀死任何人。在组织中负责重要的交易、暗杀及铲除不合格的成员的任务。给新一灌下毒药使其身体变小的罪魁祸首。
伏特加（Vodka）
配音演员：立木文彦
经常跟随在琴酒身边的黑衣组织成员。
贝尔摩德（Vermouth）
配音演员：小山茉美
真实身份为美国的大明星莎朗·温亚德，诈死后将身份转换为自己的女儿克丽丝·温亚德。被称为“神秘主义者”。曾经试图追杀叛离组织的雪莉（宫野志保，即灰原哀）。精于变装。由于在纽约受过新一和小兰的救命之恩，因此一直刻意保护两人。
波本（Bourbon）
配音演员：古谷彻
本名降谷零，化名安室透。29岁，餐厅服务生，真实身份为日本公安警察派入黑衣组织的卧底。被称为“神秘主义者”。对柯南的身份产生了兴趣。与赤井秀一相互反感，曾伪装成伤疤赤井来试探FBI，后推断出赤井未死和赤井假扮为冲矢昴活动。
基安蒂（Chianti）
配音演员：井上喜久子
组织的狙击手，与科恩搭档。很讨厌贝尔摩德。
科恩（Korn）
配音演员：木下浩之
组织的狙击手。
基尔（Kir）
即CIA探员水无怜奈。
雪莉（Sherry）
本名宫野志保，黑衣组织的科学家，“APTX4869”的发明者。因姐姐宫野明美被杀反抗组织，打算服APTX4869自尽，身体却意外变成了小孩，逃离组织后化名灰原哀。
黑麦威士忌（Rye）
即FBI搜查官赤井秀一，以诸星大的化名潜入组织，身份暴露后脱离组织。
沼渊己一郎（ぬまぶちきいちろう）
配音演员：龙田直树
黑衣组织底层成员。组织原本想培训他成为杀手，后准备将其进行人体试验。逃脱后因强盗杀人被捕。后因想再看看萤火虫，谎称埋尸于群马深山中，伺机逃脱，之后又再次被捕。
龙舌兰（Tequila）
配音演员：广田行生
身材高大的壮汉，关西口音。后来被卷入某起案件而被炸死。
皮斯克（Pisco）
配音演员：村松康雄
本名枡山宪三。曾经一度掌握了雪莉的所在，但后来由于射杀吞口议员的画面被拍下，而遭琴酒灭口。
卡尔瓦多斯（Calvados）
组织的狙击手。在一次行动中被赤井击伤后自杀。
苏格兰威士忌（Scotch）
日本公安警察派入组织的卧底，安室透的同事。卧底身份暴露后，在被组织问出名字之前被杀身亡。
宫野明美（みやのあけみ）
配音演员：胜生真沙子→玉川砂记子
宫野志保（灰原哀）的姐姐。组织的基层人员，为了让自己和妹妹脱离组织而参与了10亿元抢劫，但后来组织却出尔反尔，明美也被琴酒所杀。曾经和潜入组织卧底的赤井秀一交往。
宫野厚司（みやのあつし）
配音演员：无
科学家，明美和志保的父亲。被组织其他成员声称“因意外事故身亡”。
宫野艾莲娜（宫野エレーナ）
配音演员：铃木弘子
科学家，明美和志保的母亲。被组织其他成员声称“因意外事故身亡”。
楠田陆道（くすだりくみち）
配音演员：岩田光央
组织派出的卧底，为了寻找失踪的基尔而被组织安排装病住进杯户中央医院进行秘密调查，被识破后开车逃亡途中开枪自杀。
爱尔兰（Irish）
配音演员：干本雄之
剧场版原创人物，登场于剧场版《漆黑的追踪者》。为了调查某个与组织成员有关的案件而被黑衣组织安插进警视厅搜查小组。通过指纹对比得知柯南身份。最后被基安蒂射杀。
就先介绍这么多了。