参谋处主要负责制定战略计划、具体作战计划、指挥军队、建设军队、军校管理、平时训练、战时训练、突发应急等工作，下辖作战科、训练科、新兵科、军校科、应急科，直属作战单位新兵营。

副官处负责司令部保卫，情报收集，信息传送（电报）和文秘工作，下辖保卫科、文书科、电报科、情报科，直属作战单位卫队营与情报营。

军务处主要负责官兵军功考核、军费审核、人事安排、档案管理、军医救护、伤兵安置、退役安排等工作，下辖人事科、审评科、审计科、档案科、安置科，无直属作战单位。

军备处主要负责军械保管、兵工项目、武器采购、军火管理、武器研发、工程建设等工作，下辖军械科、军购科、军工科、军建科，直属作战单位工兵营。

后勤处主要负责军队保障方面、财产管理、财务支配、物资运输、战俘管理、军队形象宣传等工作，下辖财务科、物资科、管理科、运输科、动员科，直属作战单位辎重营。

军法处由军事法庭、稽查大队、宪兵大队和特务大队四部分组成，其中军事法庭则是对威胁二十四混成协的人事进行审判；稽查大队主要负责侦破军中案件，如失窃，挪用公款，贪污军饷，间谍渗透等案件；宪兵大队负责抓捕军队内部违反乱纪人事，监督士兵风气军纪；特务大队主要负责对威胁到军队的外部敌人实施抓捕、暗杀、谋杀、破坏等活动。

六大处各司其职，互不统属，除军务处外各有直属部队，王永安在休整的这一个月时间内全身心地投入到军队建设中，同时对军队部分人事重新进行了任命。

入秋之后，二十四混成协的建设与训练如火如荼地展开了，扬州百姓每天都能看到西洋镜一样的军事训练。

尽管王永安重新编排的司令部机构众多，可是职责明确，司令部军官们也对自己的定位非常准确，一改过去身兼数职且毫无头绪的麻烦，尤其是那些军校毕业军官们，在这次重新调配之中得到了重任，纷纷担任六大处下属各科负责人，不再担心自己遭到排挤和打击。

与此同时，王永安也对司令部进行了一番认识任命调整，明确冯衡担任参谋处处长、李耀担任副官处处长、肖湘山担任军务处处长、韩麟春担任军备处处长、罗银贤担任军需处处长、魏道风担任军法处处长。如此配置之后，二十四混成协拥有完整的司令部、作战单位和后勤保障单位。再加上王永安不断的投入，到了十月末，二十四混成协兵力扩充到了七千人，各部队基本结构已经构架完整。参谋部经过仔细分析，认为二十四混成协满编总兵力或可达到一万八千人，这严重超过了王永安的设想，所以被暂时搁置了。

十一月初，张謇等部分各省咨议局议员失落地途径扬州。

他们屡次向京师督察院递交速开国会建立内阁的请愿书，却被督察院和各个王公贵族踢皮球一般踢来踢去。各省议员们的心情越来越差，希望也越来越渺茫，除了少部分坚持之外，其余人都明白自己当真是秀才造反了，尤其是不少南方议员们，眼看着北方入冬了难以适应天气，心灰意冷离开京师。别说现在了，就算是百年之后，政协的议员们也没任何权利啊。其实这些人有点儿矫情了，这议员什么时候在中国能够真正掌权了，中国人向来都是嘴上喊共治行动上独裁，不少议员自己在家都说一不二，习惯自己说话却不让别人说话，一门心思要求朝廷建立西方式内阁，却不知道每一个国家政治体制是需要符合国民文化，若是强加西方模式，便会造成后世印度一般的尴尬。